【地理位置】高邮市位于沿江经济带的长江北岸，北纬32°38′～33°05′、东经119°13′～119°50′。市区西南经扬州市达南京市165千米，东南经无锡市、苏州市抵上海市331千米，北距北京市980千米。

【区域面积】全境南至北50.04千米，东至西57.6千米。总面积1963平方千米，其中陆地面积1175平方千米、水域面积788平方千米，占比分别为59.9%、40.1%。至年底，城区面积40多平方千米，其中建成区面积28.5平方千米。

【地形地貌】全境地势西南略高，东北偏低，多为水乡平原。高邮湖西南部属仪六低山丘陵尾端，多数海拔15米～20米，最高处神居山（火山熔岩）海拔49.5米；京杭大运河高邮段以东里下河浅洼平原由古潟湖淤积而成，河渠成网，良田万顷，一般海拔0.85米～4.8米，最低处海拔0.75米。

【水文】高邮市水面之多，居扬州市之首。美丽富饶的高邮湖有55.3%的水域面积在高邮市境内。邵伯湖北部水域和渌洋湖东北角水域亦属高邮市。境内主要灌排、交通河流有19条，即京杭大运河高邮段、澄潼河、龙须沟、人字河、张叶沟、小泾沟、三阳河、第三沟、南澄子河、南关大沟、北澄子河、东平河、横泾河、六安河、新六安河、二里大沟、子婴河、天菱河、向阳河。径流总量约1.5亿立方米。水网密度2.83千米/平方千米。

【高邮湖】为江苏省第三大湖，属平原浅水型淡水湖泊，淮河入江水道穿湖而过。水域总面积780平方千米（水位常年保持在8.5米以上），其中在高邮境内水域面积431.5平方千米。高邮湖自然风光秀丽，留有许多令人神往的传说。宋代，甓社湖曾现珠光（河蚌珠光），并为在甓社湖居室临窗夜读的著名学者孙觉亲眼所见，被其好友沈括记载于《梦溪笔谈》，故后人亦称高邮湖为珠湖。《高邮州志》记载，夏秋之际，雨过天晴，湖面上会出现“海市蜃楼”奇观（最近一次“海市蜃楼”出现于1995年8月9日上午9时左右）。其独有的西湖夕照、渔舟唱晚、珠湖雪浪、邗沟烟柳等景观，更是美不胜收。

【自然资源】高邮土地肥沃，物产丰富，素有“鱼米之乡”之称。京杭大运河高邮段以东11个乡镇、园区以种植水稻、小麦、油菜、蔬菜为主，高邮湖以西2个乡镇以种植水稻、小麦、油菜为主，其中菱塘回族乡、送桥镇分别兼种湖桑、茶叶。全市今存植物470多种，其中木本植物200多种、草本植物220多种、水生植物50多种。野生植物资源主要有柳树、刺槐树、榆树、杨树等59科、108属、177种，豨莶草、青蒿等60科、140属、200种。绿化造林树种有61科、132属、274种。其中，乔木161种，灌木99种，藤本植物14种；落叶树种162种，常绿树种112种；阔叶树种216种，针叶树种58种。淡水渔业资源丰富，碧波浩渺的高邮湖、京杭大运河高邮段以东成网的河渠、东北部成片的荡滩，为发展淡水养殖提供条件，同时也适宜高邮鸭、扬州鹅的生长。水产资源有银、鲤、青、草、白、鳝鱼和蟹、虾等63种；野生动物资源有野鸡、野鸭、秧鵽（改成简化字）、野兔、黄鼠狼等；鸟类约有120种，其中国家一级保护鸟类有东方白鹳、大鸨、丹顶鹤等。矿产资源主要有石油、天然气和品质好、储量大的矿泉水，已开发储量近千万吨的大中型油田有金沙油田和马头庄油田，神居山温泉综合水质可与冰岛蓝湖等顶级国际温泉媲美。2021年，耕地面积6.6万公顷，人均耕地约0.08公顷。